Rabu, 22 Agustus 2018

karakteristik senyawa organik bahan alam


Metabolit Primer
Produk metabolit primer Metabolit primer adalah satu grup reaksi yang saling berhubungan dalam mikroorganismayang berhubungan dengan pertumbuhan dan mempertahankan hidup. Metabolit primer secaramendasar sama pada diseluruh mahluk hidup yang berhubungan dengan pelepasan energi dansitesis makromolekul penting seperti protein, asam nukleat, dan material sel lainnya. Ketikametabolisme promer berhenti, maka organisma tersebut mati. Produk dari metabolisme primer  berhubungan dengan pertumbuhan dan produksi maksimal yang terjadi pada fase logaritmik  pada pertumbuhan dalam sistem kultur batch. Produk-produk katabolik meliputi alkohol, asamlaktat, butanol sedangkan produk anabolik seperti asam amino, enzim dan asam nukleat.
Adalah suatu zat / senyawa essensial yang terdapat dalam organisme dan tumbuhan, yangberperan dalam proses semua kehidupan organisme tersebut atau merupakan kebutuhan dasaruntuk kelangsungan hidup bagi organisme / tumbuhan tersebut.
Kehidupan organisme dibagi menjadi 2 bagian
1.Prokariot : organisme yang tidak mempunyai dinding sel (inti sel tidak punyamembran).
2.Eukariot : organisme yang mempunyai dinding sel atau mempunyai membran intisel dan organ sitoplasma, yang setiap sel digambarkan dengan adanyamembran (mitochondria, kloroplast, dll)

Fungsi metabolit primer bagi tumbuhan :
1.Diperlukan untuk memenuhi kebutuhan dasar hidup bagi tumbuhan.
2. Untuk pertumbuhan atau perkembangan bagi tumbuhan tersebut.3.

Sebagai cadangan makanan.Jalur biosintesis metabolit primer dalam tumbuhan :Proses Fotosintesis
 

Metabolism sekunder
Metabolit sekunder adalah senyawa organik yang dihasilkan tumbuhan yang tidak memiliki fungsi langsung pada fotosintesis, pertumbuhan atau respirasi, transport solut, translokasi, sintesis protein, asimilasi nutrien, diferensiasi, pembentukan karbohidrat, protein dan lipid. Metabolit sekunder yang seringkali hanya dijumpai pada satu spesies atau sekelompok spesies berbeda dari metabolit primer (asam amino, nukelotida, gula, lipid) yang dijumpai hampir di semua kingdom tumbuhan. Metabolit sekunder yang
merupakan hasil samping atau intermediet metabolisme primer:
• Berperan penting pada dua strategi resistensi, yaitu:
a) level struktur, phenyl propanoid adalah komponen utama polimer dinding polimer lignin dan suberin,
b) menginduksi antibiotik pertahanan yang berasal dari fenolik dan  terpenoid (fitoaleksin)
• Melindungi tumbuhan dari gangguan herbivor dan menghindari infeksi yang disebabkan oleh patogen mikrobia. Tumbuhan menggunakan metabolit sekunder sebagai antibiotik atau agen sinyal selama interaksi dengan patogen
•Menarik polinator dan hewan penyebar biji
•Berperan sebagai agen kompetisi antar tanaman
•Memberikan kontribusi yang bernilai terhadap hubungan antara tumbuhan dan lingkungannya

Kelompok utama metabolit sekunder ada tiga, yaitu:
terpen, senyawa fenol dan produk sekunder mengandung nitrogen.

Terpen merupakan klas metabolit sekunder yang terbesar, umumnya tidak larut dalam air, konstituen minyak esensial, lipid yang disintesis dari asetil KoA atau dari intermediet glikolisis melalui lintasan asam mevalonat. Semua terpen disusun oleh unit isopren ber-C5. Pada suhu tinggi terpen dapat didekomposisi menjadi unit-unit isopren. Terpen diklasifikas ikan berdasarkan jumlah unit isopren. Monoterpen: mengandung 10-karbon terpen atau 2 unit C5; sesquiterpen
: mengandung 15-karbon terpen atau 3 unit C5; diterpen mengandung 20-karbon terpen atau 4 unit C5. Terpen yang lebih besar termasuk triterpen (30 karbon), tetraterpen (40 karbon) dan politerpen (C5]n, dimana n > 8). Terpen disintesis untuk “menolak’ serangga, herbivor pemakan, dan untuk menarik insek predator dan parasit pemakan herbivor.
Beberapa terpen berperan pada pertumbuhan dan perkembangan. Contoh, giberelin adalah hormon penting tumbuhan yang termasuk
kelompok diterpen. Sterol adalah derivat triterpen yang merupakan komponen esensial membran sel yang menstabilkan interaksi fosfolipid. Karotenoid merah, kuning, oranye adalah tetraterpen yang berfungsi sebagai pigmen asksesori pada fotosintesis  dan melindungi jaringan fotosintetik dari fotooksidasi
Tumbuhan menghasilkan banyak produk sekunder yang mengandung gugus fenol. Senyawa ini dikelompokkan ke dalam senyawa fenolik yang jumlahnya hampir mencapai 10.000. Beberapa senyawa fenol larut dalam pelarut organik, beberapa adalah glikosida dan asam k arboksilat yang larut air dan sejumlah besar lainnya adalah polimer yang tidak larut.
 Senyawa Sekunder Yang Mengandung Nitrogen
•alkaloid yang terutama disintesis dari asam-asam amino
•Di tumbuhan senyawa ini tidak sebanyak fenolik dan terpenoid
•Senyawa ini penting dalam aktivitasnya sebagai obat dan toksin
•Disintesis dari asam amino aromatik dan alifatik
•Alifatik via siklus TCA
•Aromatik melalui lintasan asam shikimat
Metabolit sekunder tumbuhan banyak yang strukturnya memiliki nitrogen, termasuk alkaloid, sianogenik, glikosida, glukosinolat dan asam amino non protein

Eksplorasi dan Beberapa Penemuan Obat Baru dari Senyawa Alam
 Penyakit yang disebabkan Infeksi maupun Virus masih menjadi perhatian dan prioritas baik di negara Indonesia maupun di dunia. Hal ini disebabkan oleh adanya kecenderungan resistensi dan kekebalan bakteri maupun virus terhadap penggunaan obat yang terus menerus.
• Malaria masih merupakan masalah kesehatan utama di dunia baik di negara-negara berkembang maupun maju. Selain malaria, masyarakat Indonesia juga masih mengalami berbagai penyakit infeksi menular seperti tuberculosis, infeksi saluran pernafasan akut (ISPA), diare, dan penyakit kulit.
• Indonesia juga menghadapi beberapa penyakit yang ditimbulkan oleh virus, seperti demam berdarah dengue (DBD), HIV/AIDS, chikunguya, maupun Avian Flu.
•Masalah lainnya adalah penyakit kanker yang sampai saat ini belum ditemukan obatnya yang sesuai.
Salah satu usaha untuk menemukan obat baru untuk mengatasi berbagai permasalahan tersebut adalah melalui eksplorasi senyawa bioaktif dari bahan alam, utamanya tanaman obat yang secara tradisional digunakan masyarakat untuk mengobati berbagai penyakit infeksi, virus maupun kanker tersebut di berbagai daerah di Indonesia. Penemuan senyawa bioaktif baru yang dapat digunakan sebagai lead compound dari bahan alam sangat menarik untuk dilakukan .
Senyawa yang diperoleh dari tumbuhan Taxus brevifolia yang terdapat di wilayah barat laut Pantai Pasifik, Amerika seikat. Saat ini banyak digunakan untuk pengobatan berbagai jenis kanker.
Artemisia annua yang berasal  dari Cina, selama lebih dari 2000 tahun telah  digunakan oleh penduduk setempat dan di Asia sebagai obat panas. Artemisinin digunakan sebagai  obat malaria yang ampuh membunuh parasit  Plasmodium falciparum yang resisten terhadap kuinin

Alkaloid yang ditemukan pada kulit batang pohon kina (Chinchoma sp), yang sudah digunakan ribuan tahun sebagai obat malaria. Kuinin obat malaria, sedang kuinidin  sebagai obat penyakit jantung

PERMASALAHAN
1. Mengapa pada fase pertumbuhan, tumbuhan utamanya memproduksi metabolit primer, sedangkan metabolit sekunder belum atau hanya sedikit dimetabolisme?
2. mengapa suatu tumbuhan itu dapat mereduksi (melumpuhkan) pertumbuhan tumbuhan yang ada di dekatnya (tumbuhan yang lain)?
 



 

6 komentar:

  1. Pertanyaan kedua, hal itu terjadi karena pada umumnya pada saat pertumbuhan, hasil dari metabolite primer itu sangat dibutuhkan dalam prosesnya untuk tumbuh. Sedangkan hasil dari metabolite sekunder diperlukan tidak setiap saat, hanya saat tertentu saja. Seperti contohnya sebagai pertahanan diri dari predator dll. Sehingga belum terlalu dibutuhkan.

    BalasHapus
  2. Saya inin mencoba menanggapi permasalahan pertama saudari,
    Metabolit sekunder tidak diproduksi banyak pada saat pertumbuhan karena senyawa ini tidak berperan langsung dalam pertumbuhan tanaman.
    Metabolit sekunder tanaman merupakan senyawa dengan berat molekul rendah yang diproduksi tanaman sebagai respon terhadap ancaman lingkungan dan patogen

    BalasHapus
    Balasan
    1. saya ingin menambahkan. metabolit primer ini esensial pada proses hidup sedangkan metabolit sekunder tidak esensial. namun demikian metabolit primer dan sekunder saling terkait karena keduanya merupakan biomolekul yang tersusun atas unsur-unsur C, H, O, N, dan S. proses metabolisme saling terkait, dimana metabolit sekunder terjadi melalui proses biosintesis yang menggunakan prekursor senyawa-senyawa metabolit primer, yang artinya sama seperti yang dikatakan munika diatas bahwa metabolit sekunder ini akan beroperasi setelah berlangsungnya metabolit primer

      Hapus
  3. baik saya akan menambahkan jawaban agung
    Senyawa metabolit sekunder merupakan sumber bahan kimia yang tidak akan pernah habis, sebagai sumber inovasi dalam penemuan dan pengembanganobat-obat baru ataupun untuk menunjang berbagai kepentingan industri. Hal initerkait dengan keberadaannya di alam yang tidak terbatas jumlahnya. Sejalandengan hal itu dan diikuti oleh keberadaan organisme yang juga tidak terbatas jumlahnya, maka topik penelitian bahan alam juga tidak akan pernah habis. Inididukung pula oleh fakta bahwa di muka bumi ini terdapat kurang lebih 250.000 jenis tumbuhan tingkat tinggi, akan tetapi tidak lebih dari 0,4% dari jumlahtumbuhan tersebut telah diselidiki oleh peneliti untuk berbagai kepentingan.Sebagian besar dari penelitian itupun masih sangat dangkal sifatnya atau belummenyeluruh, lagi pula terbatas pada tumbuhan yang terdapat di daerah beriklimsedang. Dari 250.000 jenis tumbuhan tingkat tinggi seperti dikemukan di atas54% diantaranya terdapat di hutan-hutan tropika dan Indonesia dengan hutantropikanya yang mengandung lebih dari 30.000 jenis tumbuhan tingkat tinggisangat berpotensial untuk diteliti dan dikembangkan oleh para peneliti Indonesia.Penelitian bahan alam biasanya dimulai dari ekstraksi, isolasi denganmetode kromatografi sehingga diperoleh senyawa murni, identifikasi unsur darisenyawa murni yang diperoleh dengan metode spektroskopi, dilanjutkan denganuji aktivitas biologi baik dari senyawa murni ataupun ekstrak kasar. Setelahdiketahui struktur molekulnya biasanya dilanjutkan dengan modifikasi struktur untuk mendapatkan senyawa dengan aktivitas dan kestabilan yang diinginkan.Disamping itu dengan kemajuan bidang bioteknologi, dapat juga dilakukan peningkatan kualitas tumbuhan atau organisme melalui kultur jaringan atau pembentukan menjadi tumbuhan transgenik yang tentunya juga akanmenghasilkan berbagai jenis senyawa metabolit sekunder baru yang beranekaragam dan mungkin juga dengan struktur molekul yang berbeda dengan yangditemukan dari tumbuhan awalnya.

    BalasHapus
  4. baiklah saya akan mencoba menjawab permasalahan pertama dimana Metabolisme primer padatumbuhan, sepertirespirasidanfotosintesis, merupakan proses yang esensial bagi kehidupan tumbuhan. Tanpa adanya metabolisme primer, suatu organism akan terganggu pertumbuhan, perkembangan, serta reproduksinya, dan akhirnya mati. Berbeda dengan metabolisme primer, metabolism sekundermerupakan proses yang tidak esensial bagi kehidupan organisme. Tidak ada atau hilangnya metabolit sekunder tidak menyebabkan kematian secara langsung bagi tumbuhan, tapi dapat menyebabkan berkurangnya ketahanan hidup tumbuhan secara tidak langsung (misalnya dari serangan herbivore dan hama), ketahanan terhadap penyakit, estetika, atau bahkan tidak memberikan efek sama sekali bagi tumbuhan tersebut.
    maka dari itu Pada fase pertumbuhan, tumbuhan utamanya memproduksi metabolit primer, sedangkan metabolit sekunder belum atau hanya sedikit di metabolisme. Sedangkan metabolism sekunder terjadi pada saat sel dalam tahap diferensiasi menjadi sel yang lebih terspesialisasi (fasestasioner) (Schripsema & Verpoorte 1994, Mohr & Schopfer 1995).

    BalasHapus
  5. Baiklah saya akan menjawab permasalahan no 1
    Hasil metabolisme dalam organisme hidup dapat dibagi menjadi dua kelompok besar: metabolit
    primer dan sekunder. Yang tergolong dalam metabolit primer adalah senyawa-senyawa yang
    diproduksi dan terlibat pada jalur metabolisme primer (contohnya glikolisis, siklus asam
    sitrat/siklus Krebs, dan fotosintesis). Contoh metabolit primer adalah protein, karbohidrat,
    lipid, asam amino, nukleotida, danasetil CoA (Siegler 1998). Karbohidrat biasa disebut hidrat
    arang. Terdiri dari dua reaksi pembentukan dan pemecahan karbohidrat. Tersusun atas
    monomer molekul-molekul gula sederhana. Reaksi pemecahan terjadi di membrane sel yang
    melibatkan proses respirasi dan fermentasi. Reaksi pembentukan terjadi di dalam kloroplas
    yang melibatkan penggunaan karbondioksida untuk menghasilkan monomer gula sederhana
    misal: sukrosa). Protein merupakan salah satu metabolit primer yang menyusun tubuh
    organisme. Menurut dogma biologi molekuler, DNA akan ditranskripsi menjadi RNA, RNA
    ditranslasi menjadi triplet kodon yang membentuk asam amino, polimer asam amino
    merupakan protein. Lipida merupakan salah satu metabolit promer hasil dari jalur oksidasi
    pentose fosfat. Reaksi pembentukan lipida terjadi di dalam sitosol tanaman

    BalasHapus

Fenil Propanoid

ASAL USUL FENILPROPANOID Fenilpropanoid merupakan suatu kelompok senyawa fenolik alam yg berasal dari asam amino aromatik fenilalanin ...